ママリ
ソフトでやってます〜！
所得税の額が微妙に異なるのは、設定が税額表になってるものと、電算機特例になってるものがあるからだと思います。
あとは、支給控除項目の課税非課税の設定が上手くいってないこともあります。
所得税については、間違って天引きしても、税額表で計算しても、電算機特例で計算しても、年末調整したら全部同じ結果（年税額）になりますよ🙆🏻
社会保険料や雇用保険料は年末調整のようなことはしないので、天引き額を間違ったら計算し直して還付or徴収する必要があります。
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まいめろ
ソフトは何を使っていますか？
同じ結果になるというのは、どうしてでしょうか？
無知ですみません💦
因みに、天引きする所得税は基本給＋何か手当があれば手当(通勤手当は除く)を含めた金額から社会保険料を引くんですよね？
まいめろ
天引きする所得税で、資格手当は基本給に＋して良いんですよね🤔？
まいめろ
ありがとうございますm(_ _)m
ママリ
今は弥生ですが、PCAもマクロも使ったことあります〜
年末調整はその年の年収と社保、その他保険料控除等を基に年間の所得税額（年税額）を計算するからです。
計算した額と、1年で天引きした額の差額を還付or徴収します。
なので、年の途中の所得税の天引き額を間違うと還付額、徴収額には影響しますが、年税額には影響しません。
天引きする所得税は、おっしゃる計算で算定した金額を基に計算します😊
通勤手当が課税になる場合もあるので、それは会社の方か顧問税理士かに相談されてください。非課税通勤手当なら非課税で良いです。
ママリ
資格手当が課税かどうかというご質問ですよね？
課税になる会社が大多数ですよ😊