３ヶ月の娘が便に血が混じることが続き、血液検査などもおこなったうえ…

３ヶ月の娘が便に血が混じることが続き、
血液検査などもおこなったうえ消化管アレルギーの可能性があると診断されました。
混合栄養のため、粉ミルクの量を控えてますがまだ続きます。

アレルギー用ミルクは医師の指示なくても自分で選択して購入するものなのでしょうか？
こちらに切り替えて何か普通のミルクと変わることはありますか？